Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C10orf90Q96M02 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C10orf90Q96M02 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C10orf90Q96M02 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C10orf90Q96M02 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms