Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN2Q96LZ7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RMDN2Q96LZ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
RMDN2Q96LZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RMDN2Q96LZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms