Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDLIM2Q96JY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDLIM2Q96JY6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDLIM2Q96JY6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDLIM2Q96JY6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms