Protein–RNA interactions for Protein: Q96HC4

PDLIM5, PDZ and LIM domain protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM5Q96HC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDLIM5Q96HC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDLIM5Q96HC4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDLIM5Q96HC4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDLIM5Q96HC4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms