Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINGO1Q96FE5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINGO1Q96FE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms