Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PGBD4Q96DM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PGBD4Q96DM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD4Q96DM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD4Q96DM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms