Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DHX58Q96C10 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX58Q96C10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX58Q96C10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX58Q96C10 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX58Q96C10 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DHX58Q96C10 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX58Q96C10 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX58Q96C10 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX58Q96C10 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX58Q96C10 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX58Q96C10 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX58Q96C10 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DHX58Q96C10 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DHX58Q96C10 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
DHX58Q96C10 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms