Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COPS9Q8WXC6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPS9Q8WXC6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COPS9Q8WXC6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms