Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN9

IPCEF1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPCEF1Q8WWN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IPCEF1Q8WWN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IPCEF1Q8WWN9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms