Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TWIST2Q8WVJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TWIST2Q8WVJ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms