Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHY2

RFWD2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, humanhuman

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD2Q8NHY2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFWD2Q8NHY2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RFWD2Q8NHY2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFWD2Q8NHY2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms