Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APCDD1LQ8NCL9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APCDD1LQ8NCL9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCDD1LQ8NCL9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms