Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C15orf54Q8N8G6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C15orf54Q8N8G6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C15orf54Q8N8G6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C15orf54Q8N8G6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C15orf54Q8N8G6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C15orf54Q8N8G6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C15orf54Q8N8G6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C15orf54Q8N8G6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms