Protein–RNA interactions for Protein: Q8N187

CARF, Calcium-responsive transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARFQ8N187 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CARFQ8N187 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CARFQ8N187 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CARFQ8N187 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CARFQ8N187 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms