Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HACE1Q8IYU2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HACE1Q8IYU2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACE1Q8IYU2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HACE1Q8IYU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms