Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW03

SIAH3, Seven in absentia homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH3Q8IW03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIAH3Q8IW03 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SIAH3Q8IW03 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIAH3Q8IW03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIAH3Q8IW03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms