Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM139Q8IV31 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM139Q8IV31 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM139Q8IV31 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM139Q8IV31 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms