Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BBS12Q6ZW61 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BBS12Q6ZW61 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BBS12Q6ZW61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms