Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GBP6Q6ZN66 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GBP6Q6ZN66 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GBP6Q6ZN66 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GBP6Q6ZN66 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms