Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC62Q6P9F0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC62Q6P9F0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC62Q6P9F0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms