Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SDE2Q6IQ49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SDE2Q6IQ49 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SDE2Q6IQ49 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SDE2Q6IQ49 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms