Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RALGAPA1Q6GYQ0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RALGAPA1Q6GYQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms