Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGBQ5VZM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGBQ5VZM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGBQ5VZM2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGBQ5VZM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRAGBQ5VZM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRAGBQ5VZM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RRAGBQ5VZM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RRAGBQ5VZM2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms