Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SAMD5Q5TGI4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD5Q5TGI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SAMD5Q5TGI4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms