Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CEP78Q5JTW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CEP78Q5JTW2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CEP78Q5JTW2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms