Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRRC2BQ5JSZ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRRC2BQ5JSZ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRRC2BQ5JSZ5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRRC2BQ5JSZ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms