Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MS4A13Q5J8X5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MS4A13Q5J8X5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A13Q5J8X5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms