Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO48Q5FWF7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO48Q5FWF7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms