Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RPL39P5Q59GN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPL39P5Q59GN2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RPL39P5Q59GN2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms