Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD4Q53EL6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD4Q53EL6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD4Q53EL6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD4Q53EL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD4Q53EL6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms