Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GNPTABQ3T906 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GNPTABQ3T906 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNPTABQ3T906 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNPTABQ3T906 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms