Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANKRD55Q3KP44 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANKRD55Q3KP44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms