Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HLA-BQ31612 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-BQ31612 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-BQ31612 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms