Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDK4Q16654 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDK4Q16654 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDK4Q16654 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
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