Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TNXAQ16473 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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TNXAQ16473 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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TNXAQ16473 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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TNXAQ16473 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TNXAQ16473 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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TNXAQ16473 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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TNXAQ16473 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TNXAQ16473 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TNXAQ16473 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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TNXAQ16473 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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TNXAQ16473 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TNXAQ16473 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
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