Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZIC1Q15915 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZIC1Q15915 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZIC1Q15915 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms