Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITSN1Q15811 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ITSN1Q15811 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITSN1Q15811 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
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