Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RUNX3Q13761 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUNX3Q13761 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RUNX3Q13761 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RUNX3Q13761 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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