Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF4BQ13523 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF4BQ13523 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF4BQ13523 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF4BQ13523 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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