Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TCIRG1Q13488 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TCIRG1Q13488 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TCIRG1Q13488 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC31■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TCIRG1Q13488 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TCIRG1Q13488 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
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