Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMED1Q13445 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMED1Q13445 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED1Q13445 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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