Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MKRN4PQ13434 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MKRN4PQ13434 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MKRN4PQ13434 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
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