Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SGCGQ13326 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGCGQ13326 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCGQ13326 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCGQ13326 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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