Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SEMA3FQ13275 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SEMA3FQ13275 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SEMA3FQ13275 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SEMA3FQ13275 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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