Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TROQ12816 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
TROQ12816 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TROQ12816 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TROQ12816 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TROQ12816 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TROQ12816 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TROQ12816 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
TROQ12816 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TROQ12816 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TROQ12816 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TROQ12816 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TROQ12816 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TROQ12816 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TROQ12816 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TROQ12816 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TROQ12816 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TROQ12816 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TROQ12816 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TROQ12816 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TROQ12816 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TROQ12816 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TROQ12816 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TROQ12816 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TROQ12816 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TROQ12816 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TROQ12816 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TROQ12816 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
TROQ12816 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TROQ12816 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
TROQ12816 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TROQ12816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TROQ12816 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms