Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 IFA38YBR159W 1044 nt9.47□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 RIM8YGL045W 1629 nt9.46□□□□□ -0.89
NCR1Q12200 HEM3YDL205C 984 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 Q0092Q0092 141 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 STE2YFL026W 1296 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PFA4YOL003C 1137 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 OPI10YOL032W 741 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 ECM2YBR065C 1095 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 HAL1YPR005C 885 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 MAE1YKL029C 2010 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 LDB17YDL146W 1476 nt9.46□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 HMG2YLR450W 3138 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 ROT1YMR200W 771 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 COX7YMR256C 183 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PIN2YOR104W 849 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 IPL1YPL209C 1104 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 BET2YPR176C 978 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 CNS1YBR155W 1158 nt9.45□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PDS1YDR113C 1122 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 KSS1YGR040W 1107 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YHR140WYHR140W 720 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 HYM1YKL189W 1200 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YKR075CYKR075C 924 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PFK27YOL136C 1194 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 NPT1YOR209C 1290 nt9.44□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YDR306CYDR306C 1437 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 LSM4YER112W 564 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YFR020WYFR020W 699 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 AIM25YJR100C 984 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PSR2YLR019W 1194 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YLR365WYLR365W 333 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YNR048WYNR048W 1182 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PWR1PWR1 941 nt9.43□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YFT2YDR319C 825 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PHB2YGR231C 933 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YHR173CYHR173C 339 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YHC3YJL059W 1227 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 PEX13YLR191W 1161 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YML090WYML090W 387 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YPR109WYPR109W 885 nt9.42□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YDR222WYDR222W 1248 nt9.41□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 GLC7YER133W 939 nt9.41□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 MRF1YGL143C 1242 nt9.41□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 IES2YNL215W 963 nt9.41□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 SNF8YPL002C 702 nt9.41□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YFL052WYFL052W 1398 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 RPN5YDL147W 1338 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 NPL6YMR091C 1308 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 SWM1YDR260C 513 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 HIM1YDR317W 1245 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 YDR401WYDR401W 564 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 VAB2YEL005C 849 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 TIS11YLR136C 858 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 MRPS9YBR146W 837 nt9.4□□□□□ -0.9
NCR1Q12200 HMLALPHA2YCL067C 633 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 MATALPHA2YCR039C 633 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 DIN7YDR263C 1293 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 RTT103YDR289C 1230 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SCP1YOR367W 603 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YDC1YPL087W 954 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SFL1YOR140W 2301 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YGL114WYGL114W 2178 nt9.39□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YBR138CYBR138C 1575 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 MTF2YDL044C 1323 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 PAF1YBR279W 1338 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 RAD59YDL059C 717 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 PRE1YER012W 597 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SPO74YGL170C 1242 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 NMA2YGR010W 1188 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 FLX1YIL134W 936 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 USB1YLR132C 873 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 CDC123YLR215C 1083 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 ADH3YMR083W 1128 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 MIC27YNL100W 705 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 PET123YOR158W 957 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SMK1YPR054W 1167 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 RUD3YOR216C 1455 nt9.38□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 PEX3YDR329C 1326 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 MET2YNL277W 1461 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SHM1YBR263W 1473 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 DRE2YKR071C 1047 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YAL066WYAL066W 309 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 VTA1YLR181C 993 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 RIM11YMR139W 1113 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SPE2YOL052C 1191 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 TPO4YOR273C 1980 nt9.37□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 ITR2YOL103W 1830 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 SAM50YNL026W 1455 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YCP4YCR004C 744 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 TPC1YGR096W 945 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YIL086CYIL086C 309 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 XPT1YJR133W 630 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YJR149WYJR149W 1215 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 YKL162CYKL162C 1209 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 ENT4YLL038C 744 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 ARO8YGL202W 1503 nt9.36□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 AIR2YDL175C 1035 nt9.35□□□□□ -0.91
NCR1Q12200 LYS20YDL182W 1287 nt9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.2 ms