Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PAX8Q06710 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAX8Q06710 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PAX8Q06710 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms