Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CTDSPL2Q05D32 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CTDSPL2Q05D32 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CTDSPL2Q05D32 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms