Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP3Q02447 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP3Q02447 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP3Q02447 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP3Q02447 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP3Q02447 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP3Q02447 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP3Q02447 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP3Q02447 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP3Q02447 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP3Q02447 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP3Q02447 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP3Q02447 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP3Q02447 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP3Q02447 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP3Q02447 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SP3Q02447 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP3Q02447 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP3Q02447 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP3Q02447 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SP3Q02447 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP3Q02447 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SP3Q02447 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP3Q02447 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP3Q02447 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SP3Q02447 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SP3Q02447 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SP3Q02447 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SP3Q02447 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SP3Q02447 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP3Q02447 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP3Q02447 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP3Q02447 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SP3Q02447 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SP3Q02447 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SP3Q02447 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP3Q02447 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP3Q02447 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP3Q02447 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SP3Q02447 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP3Q02447 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP3Q02447 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SP3Q02447 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP3Q02447 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP3Q02447 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP3Q02447 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP3Q02447 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SP3Q02447 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SP3Q02447 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SP3Q02447 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SP3Q02447 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SP3Q02447 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SP3Q02447 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP3Q02447 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SP3Q02447 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms