Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DSG1Q02413 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DSG1Q02413 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DSG1Q02413 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DSG1Q02413 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms